Флаг сельского поселения Алакаевка создан на основе герба сельского поселения Алакаевка и повторяет его символику. Сельское поселение Алакаевка имеет богатую историю. В 1736 году ставропольский комиссар Моисей Александрович Богданов купил эти земли у башкирского князя Куругды Чемеева. Сын Моисея Александровича Александр был женат на дочери сызранского землевладельца (бывшая Симбирская губерния), где до сих пор существует село Алакаевка, в память о котором, возможно, было названо основанное в 1752 году Александром Моисеевичем село Алакаевка. В разное время Алакаевкой владели просветитель и гуманист Константин Михайлович Сибиряков, семья Ульяновых и купец Данилин. Семья Ульяновых проживала в селе Алакаевка в летний период с 1889 по 1893 годы. Здесь сохранился дом-музей В.И. Ленина, в котором регулярно организуются выставки, проводятся музейные мероприятия, постоянно работает экспозиция, посвященная жизни семьи Ульяновых. Неразрывную связь и гармоничное сочетание природы и сельского хозяйства сельского поселения Алакаевка символизируют единое дерево из дуба и яблони. Сельское поселение Алакаевка всегда славилось своими яблоневыми садами. Так, сад в усадьбе Ульяновых, заложенный в первые десятилетия XIX века, является одним из старейших в Самарском крае. Яблоня символизирует садоводческие сельхозпредприятия, расположенные на территории сельского поселения Алакаевка, среди которых одним из крупнейших является СХПК "Покровское". Яблоня - символ плодородия, молодости, красоты, бессмертия, братства и согласия. Дуб - преобладающая древесная порода в окрестных лесах. Желудь является символом наследия, здоровья, твердости, силы, мужественности. Корни дерева - символ основания села, фундаментального, исторического единения природных и человеческих сил и традиций по созданию и развитию сельского поселения Алакаевка. На территории сельского поселения Алакаевка находится памятник природы Муравельный лес. Свое название он, предположительно, получил из-за обилия муравейников, отдельные из которых достигают 1 метра в высоту и до 2 метров в диаметре. Благодаря присутствию в лесу колоний маленьких санитаров в нем нет вредных насекомых. Муравей - символ трудолюбия, силы, упорства в достижении цели. Примененные во флаге цвета символизируют: Зеленый цвет - символ жизни, молодости, природы, роста. Красный цвет (червлёный) - символ мужества, жизнеутверждающей силы, красоты и праздника. Жёлтый цвет (золотой) - символ высшей ценности, величия, изобилия, урожая. Белый цвет (серебряный) - символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения. | 
