Флаг сельского поселения «Арахлейское» составлен на основе герба сельского поселения «Арахлейское» и повторяет значение его символики – языком геральдических символов и аллегорий гармонично отражая состав сельского поселения, особенности географического расположения, природные богатства. Село Арахлей находится на юго-западном берегу озера Арахлей. Село основано в 19 веке и заселено в основном бурятами. Символика четырех золотых (желтых) треугольников в углах флага символически многозначно указывает на состав сельского поселения «Арахлейское» из четырех сел: Арахлей Иван-Озеро, Преображенка и Тасей. Желтый (золотой) цвет полотнища – символ богатых окрестных угодий, массивный Яблоновый хребет, лиственничных лесов, лугов и степей, которыми природа щедро одарила сельское поселение «Арахлейское». Синий (лазоревый) ромб и желтое (золотое) полотнище аллегорически показывают редкий памятник природы – Ивано-Арахлейский государственный природный ландшафтный заказник, который создан в 1995 году и является особо охраняемой природной территорией. Общая площадь 210 000 гектаров. Рельеф на большей части территории средне и плоскогорный, высшая точка имеет отметку 1335 метров над уровнем моря. В Ивано-Арахлейской котловине находятся шесть крупных озер и двадцать мелких. Все озера слабопроточные, с мягкой пресной водой. Вокруг озер в долинах, на террасах и водораздельных пространствах встречаются болотистые луга и участки сухой степи. Разнообразие природных комплексов обусловливает достаточно высокое разнообразие растительного и животного мира. Волнистое деление лазоревого ромба серебряным поясом на две части символически показывает два озера Архалей и Иван из системы Ивано-Арахлейских озёр. Озеро Арахлей местные жители называют младшим братом Байкала. Его площадь достигает 60 кв.км (ширина – 7 км, а длина – 11 км). Максимальная глубина составляет 19 метров. Озеро Арахэлэнур, так называют его буряты. В переводе с бурятского языка «хэл» означает «маленькое местечко», «ара» означает «задняя, северная сторона». Арахлей означает «мелкие северные озера». Вода в озере очень прозрачная. Озеро Арыхлей богато рыбой, особенно щукой. Иван озеро — второе по величине озеро на территории поселения после озера Арахлей. В озере обитают плотва, окунь, елец, пелядь, лещ, сазан, сом, но чаще встречается карась. Ивано-Арахлейские озера являются значительными рыбопромысловыми водоёмами Восточного Забайкалья. Рыбалка – занятие традиционное, поэтому накопленный опыт, передается местными жителями из поколения в поколение. Рыбалка возможна в любое время года. Рыбы показывают основное занятие местных жителей – рыболовство. Символика рыб неотделима от символики воды и означает всеобщее обновление природы. Примененные во флаге металлы и цвет дополняют символику: золото (желтый цвет) - символ высшей ценности, богатства, величия, постоянства, прочности, силы, великодушия, интеллекта и солнечного света; серебро (белый цвет) – символ чистоты, невинности, верности, надежности и доброты; лазоревый (синий цвет) - символ чести, славы, преданности, истины, красоты и добродетели. | 
