Флаг Чепкас-Никольского сельского поселения создан на основе герба Чепкас-Никольского сельского поселения и повторяет его символику. Местное население с давних времен занималось разведением и содержанием гусей, как на продажу, так и для себя. Разведение и содержание лучших рысаков было знаменито на всю округу. Гусь в символике означает: возрождение, духовную чистоту, бдительность, любовь, заботу о домашнем очаге, свободу, супружескую верность. Гусиное перо издревле было символом просвещения, грамотности. Идущий конь - символ силы, трудолюбия, мудрости, молодости и стремления к достижению цели. Реку Чепкасы, протекающую по территории поселения, символически показывает волнистая серебряная полоса. Применённые во флаге цвета символизируют: Синий цвет (лазурь) - символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения. Красный цвет (червлень)- символ труда, мужества, жизнеутверждающей силы, красоты и праздника. Желтый цвет (золото) - символ урожая, богатства, стабильности, уважения и интеллекта. Белый цвет (серебро) - символ чистоты, ясности, открытости, божественной мудрости, примирения. | 
