Флаг Эрзинского кожууна составлен на основании герба Эрзинского кожууна и повторяет его символику. В флаге Эрзинского кожууна языком символов и аллегорий выражено стремление местных жителей к высоко духовной и гармоничной жизни, единству с природой и верности традициям предков. Скачущий серебряный конь - символ быстрых скакунов, которыми по праву славится и городится Эрзинский кожуун, где основной экономической деятельностью является животноводство. Конь символизирует вдохновение, стремление к великим свершениям, созиданию, духовное величие человека, силу, выносливость и упорство, верность и заботу. Символика развевающейся от седла ленты может быть прочитана многозначно: - она напоминает хадак - буддистский длинный узкий платок, даримый в знак почтения, дружбы и пожелания удачи; традиционный символ чистоты, гостеприимства, доброжелательности; - крылья, как бы образованные лентой, - символ свободы, действия, которые необходимы для достижения цели. Крылья превращают коня в Коня ветра, исполняющего желания и приносящего благополучие. Символом жизненной силы является конь, несущий на спине драгоценность - в гербе символически показанную необычным седлом без попоны и креплений. Конь ветра считается защитной силой человека. Тувинцы верят, что если конь ветра у человека стоит высоко, то в делах он будет иметь успех, в жизни благополучие, будет здоровым и счастливым; - в то же время развевающаяся лента напоминает пламя - символ неиссякаемой энергии, борьбы, преодоления и памяти. Символику единства человека с природой дополняют золотые холмы и лазорево-серебряные волны. Холмы символизируют необычную природу Эрзинского кожууна, на территории которого можно встретить самые северные на планете песчаные барханы. Лазорево-серебряные волны символизируют озеро Торе-Холь, которое является уникальной достопримечательностью не только Эрзинского кужууна, но и всей Республики Тыва. Примененные во флаге цвета дополняют его символику: синий цвет (лазурь) - символ возвышенных устремлений, искренности, добродетели и свободы; желтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, богатства, урожая; белый цвет (серебро) - символ чистоты, открытости, божественной мудрости, мира. | 
