Флаг сельского поселения Ядроминское языком символов и аллегорий раскрывает его историю и особенности. Стенозубчатая полоса на красном, подобная перевязи из герба графа Чернышева, символизирует связь прошлого с настоящим. Известный генерал-губернатор Москвы (XVIII век) граф Чернышев З.Г. владел деревней Лужки (прежнее название Холуяниха), входящей в настоящее время в состав сельского поселения Ядроминское. Большое внимание граф уделял строительству дорожной сети, что способствовало развитию Истринского края и всей Московской губернии. Стена (стенозубчатая полоса) - символ надежности и самостоятельности. В то же время перевязь - аллегория Ново-Рижской автомагистрали, проходящей по территории поселения. В настоящее время в пределах Ядроминского поселения проектируется специальный переход через автомагистраль, для миграции (перехода из одного месторасположения в другое) диких животных, в том числе лосей. Лось символизирует богатую природу сельского поселения. Выходящее сияющее солнце символизирует неразрывную историческую связь сельского поселения Ядроминское с Истринским районом: солнце - фигура флага и герба Истринского муниципального района. Красный цвет - символ мужества, жизнеутверждающей силы и красоты, праздника, труда. Голубой цвет (лазурь) - символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения. Белый цвет (серебро) - символ чистоты, ясности, открытости, божественной мудрости, примирения. Желтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, великодушия, богатства, урожая. | 
