Муниципальное образование Кутопьюганское создано путем объединения муниципального образования село Кутопьюган и муниципального образования село Нори. Первые упоминания о населённом пункте Кутопьюган относятся к концу XVIII - началу XIX века. Кутопьюган в переводе с хантыйского языка означает "средняя река". В устье реки Кутопьюган, на её правом высоком берегу и расположился посёлок, который первоначально развивался, как пункт обмена пушнины и оленьего мяса на соль, хозяйственную утварь, орудия лова, порох, дробь. Основную массу жителей посёлка представляют потомки кочевых оленеводов, охотников, рыбаков. Село Нори, расположенное в таежной зоне на берегу протоки, впадающей в реку Правый Ярудей, было основано в конце 19-го столетия. Первопричиной образования Нори была торговля. Водным путем из Тобольска через Обскую губу товар завозился в село. В те далекие времена тобольские рыбопромышленники доставляли сюда все необходимое для жизни оленеводов, рыбаков и охотников. Зимой здесь собиралось много ненцев, которые запасались продуктами питания и всем необходимым для длительной жизни в стойбищах. Около половины населения представители коренных малочисленных народов Севера - ненцы и коми-зыряне. Основными занятиями трудоспособного населения сельского поселения Кутопьюганское являются оленеводство, охота, рыболовство, пошив меховой одежды. Символика флага сельского поселения Кутопьюганское многозначна: - зеленая часть полотнища - цвет тайги в летнее время, аллегория земель поселения, пастбищ для оленей; - чум - форма жилища, распространённая у финно-угорских народов. По преданиям многих северных народов, чум и человек появились почти одновременно. И это недалеко от истины. Для местных жителей чум не только место ночевки или укрытия от непогоды, но и место встречи, общения, хранения очага и традиций; - северное сияние - уникальное природное явление - символ расположения поселения в полярных широтах; - олени, сопровождающие чум - символ самобытной фауны поселения. Олень для местного населения - это спутник всей жизни. Это не только транспортное средство, обеспечивающее передвижение по тундре и тайге без всяких дорог, но это и источник пропитания, одежды, обуви и обустройства жилищ. В то же время олень - благородное неприхотливое животное, символ бесстрашия и выживаемости в суровых условиях крайнего севера. Количество оленей символически отражает количество населенных пунктов составляющих единое поселение; - голубая часть полотнища - символ водных объектов, расположенных на территории поселения, в том числе и речки Кутопьёган (бассейн Оби). - осетр - символ богатой рыбной фауны здешних рек и озер; Зеленый цвет символизирует весну и природу, здоровье, молодость и надежду. Голубой цвет (лазурь) - символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения. Белый цвет (серебро) - символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения. Желтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, богатства, урожая. | 
