Флаг разработан на основе герба Михайловского сельского поселения. Планомерное освоение земель вошедших в состав территории современного муниципального образования началось в 1868 году с основания хутора Красницкого на правом берегу реки Ушед впоследствии, после строительства Михайло-Архангельской церкви, переименованного в село Михайловское. В настоящее время на территории муниципального образования дружно и мирно проживают представители двадцати национальностей, о чем в гербе символизирует цветок ромашки о двадцати лепестках. Цветок - традиционный символ добра, красоты и любви. Композиция флага аллегорически отражает уникальные природно-географические особенности, повлиявшие на развитие экономики. Большая часть границы Михайловского поселения проходит по берегу Крюковского водохранилища, водные ресурсы которого позволили создать систему рисовых чеков, дающих стабильно высокие урожаи. Водохранилище обозначено на флаге голубым цветом. Черный цвет - символ плодородия, в сочетании с рисовыми колосьями отражает в гербе развитое сельское хозяйство как основу экономики муниципального образования. Желтый цвет (золото) - символ урожая, богатства, стабильности, уважения; цвет спелых нив дополняет сельскохозяйственную символику герба. Белый цвет (серебро) - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания. Голубой цвет - символ чести, благородства, духовности; цвет водных просторов и бескрайнего неба. | 
