Флаг разработан на основе герба сельского поселения Мочильское. Территории, вошедшие в состав сельского поселения Мочильское имеют многовековую историю. По утверждению ученых здесь расположено древнее Мочильское городище, существовавшее до татаро-монгольского нашествия. Село Мочилы - центр сельского поселения, впервые упоминается в XVI столетии в Писцовых книгах. Желтая восьмиконечная звезда символизирует памятник архитектуры - церковь Рождества Христова, построенную в Мочилах одним из владельцев премьер-майором Яковом Михайловичем Масловым в 1793 году. Звезда - традиционный символ высоких стремлений, идеала, путеводности, в христианстве звезда один из символов праздника Рождества Христова. Современное сельское поселение сохраняет традиционный уклад экономики ориентированный на сельскохозяйственное производство. Одним из приоритетных направления является растениеводство, показанное снопом и цветовой гаммой - золотом и зеленым цветом. Перемена цвета снопа с зеленого на золотой аллегорически показывает полный сельскохозяйственный цикл от подготовки полей под посевы до сохранения собранного урожая. Зерновое хозяйство является основным, на полях сельского поселения главным образом выращивается пшеница. Мочильское поселение - одно из немногих в Московской области, где растет кукуруза, идущая на производство комбинированных кормов для сельскохозяйственных животных. Желтый цвет (золото) - символ урожая, богатства, стабильности, уважения интеллекта Зеленый цвет - символ природы, здоровья, молодости, жизненного роста. Белый цвет (серебро) - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания. Сочетание белого цвета и зеленого на флаге поселения перекликается с цветовой гаммой герба Серебряно-Прудского муниципального района, подчеркивая историческое и территориальное единство двух муниципальных образований. | 
