Флаг Надеждинского сельского поселения составлен основе герба Надеждинского сельского поселения и повторяет его символику. Надеждинское сельское поселение богато географическими и религиозно-культурными достопримечательностями, которые нашли отражение в его флаге. Село Надеждино - административный центр Надеждинского сельского поселения - основано в 1852 году, однако многие постройки на территории Надеждинского сельского поселения имеют ещё более древнюю историю. Кресты символизируют Надеждинское сельское поселение как центр сосредоточения религиозной жизни и паломничества: здесь находятся мужской Свято-Никольский монастырь, "Живоносный источник" во имя иконы Божией Матери, многочисленные родники, где богослужения проводятся еще с в XVIII века, скит в честь преподобного Александра Свирского и многие другие. Краткая история Свято-Никольского монастыря такова: первое упоминание о строительстве храма в селе Кулачинском относятся к 1751 году, когда Иван Миронович Круглов с другими односельчанами выстроил деревянную церковь во имя Святителя и Чудотворца Николая. Несколько раз впоследствии церковь перестраивалась, пока в 1905 году не был построен каменный храм. В 1960-е годы он был разрушен. Храм вернули верующим в 1989 году, а в августе 1995 года началась новая иноческая жизнь Свято-Никольской обители, которая с каждым годом привлекает все большее и большее число паломников со всех краев, а крестный ход на Крещение собирает до тысячи человек. Вилообразный крест и три малых креста с лучистым сиянием на нем символизирует омофор Святителя и Чудотворца Николай Мирликийского - сакральный для верующих атрибут святого, имя которого носит монастырь в Надеждинском сельском поселении. При этом каждое плечо вилообразного креста символизирует один из трех населенных пунктов, составляющих Надеждинское сельское поселение: село Надеждино, деревню Большекулачье и поселок Дачный. Вогнутым волнистым поясом показана интересная географическая особенность Надеждинского сельского поселения - подковообразное озеро Большекулачье (старица Надеждинская), образованное руслом Иртыша, которое в былые времена проходило здесь. Фигура, образованная крестом, нижнее плечо которого пересекает вогнутый пояс, образно напоминает якорь - символ надежды и гласная аллегория названия Надеждинского сельского поселения. Примененные во флаге цвета дополняют его символику: Малиновый цвет (пурпур) символизирует древнее происхождение, достоинство, благочестие, щедрость; синий цвет (лазурь) - символ возвышенных устремлений, искренности, благородства; черный цвет символизирует благоразумие, скромность, честность; белый цвет (серебро) - символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения; желтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, богатства, урожая. | 
