Флаг Никольского сельского поселения создан на основе герба Никольского сельского поселения и повторяет его символику, где языком геральдических символов и аллегорий отражены его история, природа и административный состав. Одной из важных вех в истории Никольского сельского поселения стало основание в 1775 году церкви, от которой пошло современное название сельского поселения. Открытие церкви состоялось на праздник летнего Николы. Поэтому она была названа Никольской, и село стали называть Никольским в честь церкви, красивый колокольный звон и богатый церковный хор которой привлекали людей со всей округи. Никольская церковь имела большой приход. При ней была открыта и церковно-приходская школа. В послевоенные годы долгое время церковь Николая Чудотворца стояла разрушенной, в 1990-е годы началось её восстановление, в 2000 году церковь освятили, и в настоящее время она вновь открыта для прихожан. Символика сапсана во флаге Никольского сельского поселения многозначна: парящий сапсан - символ возвышенного духа, возрождения, что аллегорически символизирует церковь Николая Чудотворца и взаимосвязь её истории с историей Никольского сельского поселения; сапсан - символ богатой природы Никольского сельского поселения; сапсан - символ целеустремленности, скорости, силы и красоты. Горицвет весенний (желтый), занесённый в Красную книгу Белгородской области (категория статуса редкости VI - особо ценный вид), можно встретить повсеместно на территории Никольского сельского поселения. Дополняя символику сапсана, горицвет символизирует природу Никольского сельского поселения и изобилие местной флоры. Два цветка горицвета образно символизируют два населенных пункта: села Никольское и Пуляевка, входящие в состав Никольского сельского поселения. Черный и зеленый цвета полосы, расположенной вдоль древка флага Никольского сельского поселения, перекликаются с цветами герба и флага Белгородского района, что символизирует принадлежность Никольского сельского поселения к Белгородскому району. Четырехлучевая звезда на середине черно-зеленой полосы символически показывает Журавлевское сельское поселение как одно из муниципальных образований Белгородского района (подобная звезда присутствует на полковом знамени Белгородского пехотного полка, составленного во времена Петра I в 1712 году). Звезда символизирует надежду, целеустремленность в достижении мечты, путеводность, во все времена указывая людям верный путь. Такая полоса со звездой, расположенная вдоль древка флага Никольского сельского поселения, изображена во флагах всех городских и сельских поселений Белгородского района, тем самым создавая их геральдическое единство. Примененные во флаге цвета дополняют его символику: синий цвет (лазурь) - символ возвышенных устремлений, искренности, добродетели и свободы; зеленый цвет символизирует природу, весну, здоровье, молодость и надежду; черный цвет - символ мудрости, вечности и покоя; желтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, достатка, стабильности, интеллекта. | 
