Флаг Овюрского кожууна составлен на основании герба Овюрского кожууна и повторяет его символику. Овюрский кожуун, основанный 12 марта 1941 года, расположен в юго-западной части республики Тыва, на границе с Монголией. Территория Овюрского кожууна раскинулась по южным склонам горного хребта Танды-Уула (Танну-Ола). Основная гряда гор тянется вдоль северной границы кожууна, спускаясь к югу платообразной и холмистой равниной. Во флаге Овюрского кожууна символически показаны отроги гор Танды-Уула, червленый (красный) цвет которых символизирует не только её южные склоны, где находится кожуун, но и преобладающие здесь степи, сложенные песчаниками, сланцами, конгломератами (западная часть), эффузивно-осадочными породами и гранитами (восточная часть). Белый цвет (серебро) на вершинах гор одновременно символизирует снег, а также Дус-Дагское месторождение соли и различные металлы, в первую очередь кобальт, активно добываемый в этих горах ранее. Гора - символ устойчивости, неизменности, твердости и ориентира. Солнце - символ тепла, энергии, света, провидения, богатства и жизни - отражает, вместе с тем, расположение Овюрского кожууна в южной части Республики Тыва. Часть территории Овюрского кожууна относится к обширной Убсунурской котловине - заповеднику, включенному в список объектов всемирного наследия ЮНЕСКО в 2003 году. Заповедник интересен своим смешением сложных экологических сред обитания: это и тайга, и тундра, и альпийские луга, и пустыни; горно-таежные районы и ледники; степи и полупустыни. На территории Овюрского кожууна в районе озера Убсу-Нур распространены каштановые и светло-каштановые почвы, сухие степи и солончаки, показанные золотой (желтого цвета) нижней частью поля флага. На землях Убсунурской котловины обитают около 360 видов пернатых и 80 видов млекопитающих. Многие виды являются редкими и исчезающими, а некоторые встречаются только здесь. Символика лосиных рогов многозначна: - лось - славный представитель и символ богатой фауны Овюрского кожууна, являющейся частью большой экосистемы Убсунурской котловины; - лосиные рога - гласный символ названия административного центра Овюрского кожууна села Хандагайты: слово "хандагайты" с монгольского языка переводится как "лосиный"; - шесть отростков на рогах символизируют шесть сумонов (сельских поселений), входящих в состав Овюрского кожууна: Хандагайтинский, Дус-Дагский, Саглынский, Сарыг-Хольский, Солчурский, Чаа-Суурский; - рога символизируют животноводство, издавна широко распространенное в Овюрском кожууне; - лось - символ выносливости, силы, независимости, достоинства и благородства, неудержимой страсти и напора; - стилизованно-орнаментально изображенные рога символизируют самобытную культуру Овюрского кожууна. Примененные во флаге цвета дополняют его символику: синий цвет (лазурь) - символ чистого неба, возвышенных устремлений, взаимоуважения и согласия в обществе; красный цвет (червлень) - символ труда, мужества, жизнеутверждающей силы, красоты и праздника; белый цвет (серебро) - символ благородства, божественной мудрости, примирения, цвет молока, почитаемого тувинцами; жёлтый цвет (золото) - символ солнца как источника жизни, изобилия и искренности, высшей ценности, величия и богатства. | 
