Флаг Подгоренского муниципального района составлен на основании герба и языком символов и аллегорий отражает исторические и природные особенности района. Подгоренский район расположен в юго-западной части Воронежской области на берегах реки Дон. Районный центр - поселок Подгоренский - основан как слобода Подгорное в начале XVIII века. Главная фигура флага - белая гора - говорит о названии района. По имеющимся сведениям хаты первых поселенцев появились вблизи оврагов меловых круч "под горою", откуда и пошло название селения, а впоследствии и района. Район расположен на юго-восточных отрогах Средне-Русской возвышенности, и его территория изрезана оврагами и балками. Белая гора с пещерой и желтым колоколом, символизирует святые места Подгоренского района, которые и по сей день обладают притягательной силой. Одной из жемчужин Воронежской области являются белогорские, семейские и костомаровские пещеры и расположенные в них пещерные храмы. Двухпрестольный пещерный собор, при входе в который возвышаются меловые столбы - "дивы", является уникальным памятником. Колокол - символ "духовного начала". Белая гора символизирует также уникальное месторождение мергеля (смеси известняка и глины, приготовленной самой природой), открытое А.А.Дубянским на южном участке "Белой горы", давшей название селу Подгорное. На базе этих мергелей с 1932 года работает цементный завод, который способствовал экономическому развитию Подгоренского района. Желтый цвет (золото) - символ богатства, уважения, интеллекта, стабильности. Белый цвет (серебро) - символ мира, взаимопонимания, чистоты. Голубой (синий) цвет - символ возвышенных устремлений, мышления, искренности и добродетели. Голубая оконечность дополняет символику флага и показывает географическое расположение района в бассейне реки Дон. Красный цвет символизирует труд, жизнеутверждающую силу, мужество, праздник, красоту. | 
