Флаг Шелеховского района составлен на основании герба Шелеховского района и повторяет его символику. Шелеховский район носит имя известного русского путешественника и исследователя, купца Григория Ивановича Шелехова (Шелихова). Он начал торговлю на окраинах Сибири, занимаясь промыслом морских животных и основывая русские поселения на новых землях. Г. И. Шелехов развивал кораблестроение, хлебопашество, организовывал исследования окружающих земель и населяющих их народов. Г. И. Шелехов - основатель Российско-Американской компании, один из первых исследователей Курильских островов, инициатор торговых отношений с Японией. Золотой корабль во флаге Шелеховского района символизирует промысловую шхуну "Галиот", ходившую под командованием Г. И. Шелехова. На трех парусниках-"галиотах" в 1783 году экспедиция Г. И. Шелехова достигла берегов Аляски. Парусник - символ странствий, поиска и открытий; раздутые паруса символизирую движение, надежду, удачу и мечту. Геральдические фигуры - лазоревые столбы (синего цвета) символизируют не только морские просторы, исследованные смелым первооткрывателем Г. И. Шелеховым, но и расположение Шелеховского района на равнине между реками Иркутом и Олхой. Столбы во флаге показаны и как символ опоры, основы и надежности. Жарок во флаге Шелеховского района подчеркивает неповторимую сибирскую природу. На территории района находятся целебные источники радона и сероводорода, сохранились уникальные лесные массивы, богатые пушным зверем. В то же время, цветок с листьями, расположенными по бокам снизу, своей формой образно напоминает якорь, что дополняет символику корабля. Во флаге Шелеховского района корабль, лазоревые столбы и жарок-якорь символизируют память потомков о заслугах человека, чьим именем назван центр района - город Шелехов и сам Шелеховский район. Белое полотнище аллегорически символизирует алюминий - металл серебристого (белого) цвета. Градообразующим предприятием города Шелехова - административного центра Шелеховского района - является один из крупнейших в стране заводов по производству алюминия. Примененные во флаге цвета дополняют его символику: красный цвет (червлень) - символ борьбы, свободы, тревоги, мужества, силы, труда, красоты; синий цвет (лазурь) - цвет морских просторов и мечты о чистом небе, символ духовности; желтый цвет (золото) - символ богатства и благородства людей, уважения, интеллекта, урожая, стабильности, белый цвет (серебро) - символ чести, достоинства, чистоты помыслов, совершенства, мира и взаимопонимания. | 
