Флаг разработан на основе герба Верхнеимбатского сельсовета. История села Верхнеимбатск тесно связана с освоением Россией Западной Сибири и строительством торгово-промыслового центра и порта - Мангазеи - современного села Туруханск. Утвердившись в Мангазее царские воеводы начали осваивать окружающие земли. Для этого в 1607 году был построен ряд зимовий, одно из которых Имбакское - на реке Имбак. С этого времени и до настоящего дня жизнь русских переселенцев проходит в тесном соседстве и сотрудничестве с местными народами: кетами, эвенками, ненцами. Об этом в гербе свидетельствует изображение желтого бубна - традиционного местного национального музыкального инструмента, использующегося во время важных церемоний и обрядов местных народностей. На флаге также нашли свое отражение природное богатство края и традиционные промыслы: - огромную роль в жизни местных жителей играет река - это и дорога, связывающая с другими людьми, и кормилица: рыбная ловля один из основных здешних промыслов. На флаге об этом говорит синий цвет и изображение рыбы. - Две головы северных оленей символизируют традиционный промысел коренного населения - оленеводство. Белый цвет (серебро) - символ чистоты, совершенства, бескрайних северных просторов, мира и взаимопонимания. Желтый цвет (золото) - символ богатства, стабильности, жизненного тепла, интеллекта и уважения. Синий цвет - символ чести, добродетели, возвышенных устремлений и духовности; также символ водных просторов и бескрайнего чистого неба. | 
