Флаг Богородского района разработан на основе герба Богородского района и повторяет его символику. Первые населенные пункты на территории Богородского района, основанные ремесленниками из Новгорода Великого, появились в XVI веке. Одно из них получило название Богородское - в честь построенной в XVII веке церкви, а затем собора Рождества Пресвятой Богородицы. Православный храм является символом названия Богородского района. Деление поля флага на три вертикальные части символизирует географическое расположение исторической местности Березополье - основы будущего Богородского района - в междуречье Оки и Кудьмы. Три шкуры - символ кожевенного ремесла, исконного занятия жителей Богородского района. Примененные во флаге цвета символизируют: Зеленый цвет символизирует весну, здоровье, молодость, а также природные богатства, которыми щедро наделена территория района: поля, луга, леса. Синий цвет (лазурь) - это символ чести, благородства, духовности и нравственности, кроме того, лазурь символизирует реки Оку и Кудьму. Желтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, богатства, урожая. Белый цвет (серебро) - символ простоты, совершенства, мудрости, мира и взаимного сотрудничества. | 
