Флаг Богучарского муниципального района составлен на основе герба и языком символов и аллегорий отражает исторические, природные и экономические особенности района. Богучарский район расположен на юге Воронежской области. Центр района - город Богучар - появился в начале ХVIII века. При разработке флага Богучарского муниципального района использована фигура и цвет поля исторического герба уездного города Богучара, пожалованного императрицей Екатериной Великой 21 сентября 1781 года, подлинное описание которого гласит: "... зверекъ, называемый хорекъ, въ золотомъ поле, каковыхъ въ окрестностяхъ сего города очень много". По имеющимся сведениям Богучар был основан казаками украинского происхождения (черкасами), которые в 1717 году основали слободу Богучар и образовали Богучарскую сотню Острогожского полка. В память о казачьем происхождении города на флаге изображен бунчук. Расположение Богучарского муниципального района в степной зоне с умеренным климатом и черноземными почвами обусловило то, что сельское население Богучарского уезда в основном занималось земледелием и животноводством. Желтые пояс и цеп, одно из древнейших земледельческих орудий, показывают, что сельское хозяйство и сейчас является основой экономики района. Географическое расположение района способствовало развитию торговли, которая отражена золотым кадуцеем - Меркуриевым жезлом (Меркурий - покровитель торговли). Два раза в год в Богучаре проходили крупные ярмарки. Богучарские купцы кроме домашних торгов в городских лавках все лето ездили на ярмарки. Жезл представляет собой вертикаль, объединяющую все элементы герба, как бы собирающий в одно целое объединяющее начало. Жезл является символом власти, богатства, мудрости, единоначалия. Он олицетворяет связь времен - древности и современности. Крылья на вершине жезла символизируют стремление к совершенству. Змеи в изображении жезла - символ мудрости, духовного и физического здоровья. Спираль из тел змей - символ духовного поступательного развития. Желтый цвет (золото) - символ богатства, уважения, интеллекта, стабильности. Белый цвет (серебро) - символ мира, взаимопонимания, чистоты. Голубые полосы полотнища дополняют символику флага и показывают географическое расположение района в бассейнах рек Дон и Богучарка. В районе находится уникальный Белогорский источник минеральной воды. Вода из этого источника по своему химическому составу и бальнеологическим свойствам является единственной в России и второй в мире. Голубой (синий) цвет - символ возвышенных устремлений, мышления, искренности и добродетели. | 
