Флаг Бурейского муниципального округа разработан на основе герба Бурейского муниципального округа и повторяет его символику, языком геральдических символов и аллегорий лаконично отражая особенности его местности, история, основной вид деятельности местного населения. Фигура острия показывает древний водный путь и географическое расположения района - на юго-востоке Амурской области в бассейне нижнего и частично среднего течения реки Буреи. Бурея – это левый приток Амура, протекающий по территории Азиатской части России в Амурской области и Хабаровском крае. Он образован соединением двух рек – Правая и Левая Бурея, и принадлежит к водному бассейну Охотского моря. Бурея переводится с эвенкийского языка как «Большая». В ХVII веке река называлась Быстрая и упоминалась еще во времена походов казаков на Амур. Бурея – это быстрый, многоводный и холодный поток, рожденный в горной местности в условиях многолетней мерзлоты и суровых климатических условий. Основное хозяйственное использование реки Бурея – это Бурейская гидроэлектростанция, вырабатывающая электроэнергию, питающей Хабаровский и Амурский край. С технической точки зрения Бурейская ГЭС – одна из самых современных и экологичных электростанций России. Бурейский энергетический комплекс включает в себя два объекта: Верхне-Бурейская ГЭС и Нижне-Бурейская ГЭС – аллегорически изображенных во флаге Бурейского муниципального округа виде двух звезд. Восьми лучевые звезды, взяты из областного герба и показывают принадлежность округа к Амурской области. Звезда – символ света, энергии; это древнейший символ путеводности и достижения цели. Примененные во флаге цвета символизируют: Белый цвет (серебро) - символ простоты, совершенства, мудрости, благородства, мира и взаимного сотрудничества. Желтый цвет (золото) - символ прочности, постоянства, величия, силы, великодушия, богатства. Зелёный – символ роста, надежды, плодородия, природы и здоровья. | 
