Флаг Бурлинского района составлен на основании герба Бурлинского района и повторяет его символику, языком геральдических символов и аллегорий лаконично отражая природные богатства. Во все фигуры флага заложена многозначная символика. Бурлинский район расположен в северо-западной части Алтайского края. Административный центр – село Бурла, расположенное в 500 км от Барнаула. На территории Бурлинского района находится «Пеликаний заказник». В летний период времени в заказнике можно увидеть большое скопление кудрявого пеликана, внесенного в Красную книгу Российской Федерации. Символика пеликана многозначна: – символ и представитель богатой фауны Бурлинского района, где помимо пеликана можно увидеть множество других птиц; – символ экологической чистоты местных полей, лугов, озер и рек. На территории Бурлинского района находится озеро Большое Кабанье богатое разнообразной рыбой. В озере обитают карась, окунь, плотва, судак, подлещик, щука, уклейка, но чаще встречается сазан. Символика рыбы неотделима от символики воды и означает всеобщее обновление природы. Синяя (лазоревая) часть флага дополняет символику и аллегорически показывает, что на территории Бурлинского района протекает река Бурла, образуя сеть пресноводных озер – Большое Кабанье (на его территории заказник), Малое Кабанье (Фрунзе), Хомутиное, Песчаное, Травное, Кривое, Большое Топольное. Серебряные волны и белая (серебряная) часть флага – символ кристально-чистой воды и рыбных богатств, реки и многочисленных озер, находящихся по территории района. Перемена цвета с лазури на серебряный цвет аллегорически указывает на единство трудов человека и природных богатств. Применённые во флаге цвета и металлы символизируют: золото (желтый цвет) – символ высшей ценности, величия, богатства, урожая; серебро (белый цвет) – символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения; лазурь (синий цвет) – символ искренности, чести, славы, преданности, истины и добродетели. | 
