Флаг муниципального образования город Меленки создан на основе герба муниципального образования город Меленки и повторяет его символику. Первые письменные упоминания о селе Рогожино, находившемся на месте современного муниципального образования город Меленки, относятся к началу XVIII столетия, хотя существует легенда, что в 1463 году переселенцы из разоренной татарами Костромы основали на берегу речки Унжи село Приклон, а потом, с увеличением населения, выделилось из него селение Меленки. Само название Меленки известно также с XVIII столетия и в 1779 году в ходе административно-территориальной реформы Меленки получили статус города. 16 августа 1781 года городу был Высочайше пожалован герб, подлинное описание которого гласит: "Въ верхней части гербъ Владимiрскiй. Въ нижней - въ голубомъ пол?, золотая в?тряная мельница, означающая имя сего города". Реконструкция исторического герба, гласно отражающего название города, в качестве официального символа современного муниципального образования символизирует бережное отношение жителей к прошлому своей малой Родины, преемственность поколений, сохранение традиций. Примененные во флаге цвета символизируют: - зеленый цвет - символ природы, здоровья, молодости, жизненного роста; - голубой цвет (лазурь) - символ чести, благородства, духовности; цвет бескрайних небесных просторов; - желтый цвет (золото) - символ урожая, богатства, стабильности, уважения и интеллекта. | 
