Флаг разработан на основе герба села Новый Порт. Поселок Новый Порт (с 2006 г. село) основан в 1920 году отрядом гидрографов как пункт товарообмена экспедиций моряков и сибирских речников. В 1931 году здесь был образован Новопортовский рыбный промысел Обьгосрыбтреста, тогда же построен рыбоконсервный завод и сезонная плавучая фабрика. В середине ХХ столетия в поселке Новый Порт было создано уникальное по своей протяженности вечномерзлотное рыбохранилище, рассчитанное на хранение 1700 тонн рыбы. Флаг языком символов и аллегорий отражает природно-географические и экономические особенности муниципального образования: - якорь - символ опоры, надежности, стабильности не только указывает на порт, ставший причиной появления поселка, но и на само название - Новый Порт, делая композицию флага гласной; - нельмы символизируют рыбный промысел - одно из основных занятий местного населения; - голубой цвет символ водных просторов и бескрайнего неба отражает расположение села на берегу Карского моря. Голубой цвет - символ чести, благородства, веры, духовности. Северный олень не только образно отражает северное расположение муниципального образования, но и указывает на национальные особенности - основу населения составляют ненцы, традиционным занятием которых является оленеводство. Бегущий олень символизирует устремленность в будущее, движение вперед, развитие. Желтый цвет (золото) - символ богатства, стабильности, уважения, интеллекта. Белый цвет (серебро) - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания. Серебро - цвет северных бескрайних просторов. | 
