Флаг города Тулуна составлен на основании герба города Тулуна и повторяет его символику. Тулун основан в первой половине XVIII века в южной части Средне-Сибирской возвышенности на берегу реки Ия, притока Оки. Как считают историки, основателями поселения были буряты-кочевники. Продвигаясь по течению реки Ия, первые поселенцы обживали прилегающие территории. Название города Тулуна (которое в переводе с бурятского языка означает "кожаный мешок") отражает его географическое расположение: город находится в излучине реки, как бы в мешке. Фигура с синим подковообразным углублением в центре символизирует эту характерную географическую особенность местности - изгиб реки Ия, на берегу которой зародился и вырос город Тулун. В 1907 году на территории города Тулуна была открыта опытная ферма, ставшая родоначальницей Тулунской государственной селекционной станции, учеными которой было создано свыше шестидесяти сортов различных культур. Тулунскую государственную селекционную станцию символизирует колос - традиционный символ единства, плодородия, изобилия, а также земледелия. Зеленая часть поля символизирует леса, которыми покрыта территория города Тулуна. Черная часть поля символизирует полезные ископаемые (в первую очередь каменный уголь), которыми богаты недра окрестностей города Тулуна. Примененные во флаге цвета дополняют его символику: зеленый цвет - символ здоровья, обновления, природы, флоры и фауны, а также лесных богатств; синий цвет (лазурь) - символ возвышенных устремлений, искренности, преданности; черный цвет - символ плодородия, мудрости, скромности, вечности бытия; белый цвет (серебро) - символ совершенной пустоты, из которой рождается Вселенная, священный для бурятов цвет молока, используемый в обрядах очищения и исцеления, символ открытости, божественной мудрости, примирения; желтый цвет (золото) символизирует богатство бурятской земли, солнечный свет, высшую ценность, величие. | 
