Флаг разработан на основе герба сельского поселения. Земли, входящие в Заболотьевское сельское поселение, расположены на юго-востоке от Москвы вблизи города Раменское. Символика флага многозначна, она отражает исторические, природные и экономические особенности Заболотьевского сельского поселения: - Волнистое, диагональное деление полотнища символизирует протекающую с северо-запада, на юго-восток Москву-реку, а отходящие попеременно в разные стороны ростки - аллегория сети многочисленных каналов созданных для осушения болот. - Ранее большая часть территории поселения находилась в заболоченной местности, теперь же здесь проведены мелиорационные работы, ставшие залогом успешного развития сельского хозяйства. Деление щита на две части с проросшими камышами и хлебными колосьями аллегорически показывает прошлое и настоящее сельского поселения; огромный труд людей, который превратил болота в плодородные пашни и луга. - Композиция флага отражает название сельского поселения - Заболотьевское, делая флаг косвенно гласным. Желтый цвет (золото) - символ урожая, богатства, стабильности, уважения, солнечного тепла. Белый цвет (серебро) - символ чистоты, совершенства, мира и взаимопонимания. Зеленый цвет - символ природы, роста, молодости, жизненных сил. Черный цвет - символ мудрости, скромности, плодородия. | 
