По последним данным, место, где расположено современное городское поселение Запрудня, было заселено более 500 лет назад. Грамота 1506 года подтверждает существование села Гари, территория которого в настоящее время входит в состав городского поселения. Деревня Запрудня впервые была упомянута в "Писцовых книгах" Дмитровского уезда более 370-ти лет тому назад. Она возникла на берегу речки Куновка, у запруды, которая образовала небольшое озеро. В то время Запрудня находилась в стороне от крупных населенных пунктов и дорог. До ближайшего уездного города Дмитрова было 30 верст, и даже проложенная в конце XIX века Савеловская железная дорога прошла в 15 верстах от Запрудни. Ситуация изменилась в середине ХХ века, когда недалеко от Запрудни прошла трасса канала Москва-Волга. Вдоль канала была проложена шоссейная дорога, которая проходит у окраины поселка. Статус поселка городского типа был получен в 1932 году. Голубая полоса на флаге поселения - аллегория канала имени Москвы, проложенного рядом с поселением. Запруда на флаге - символически изображена в виде желтой (золотой) полосы. Почетное место на флаге занимает яблоня с цветами и с яблоками - символ яблочного Спаса. Яблочный Спас или Второй Спас (в отличии от первого медового Спаса и третьего: перенесение Нерукотворного Образа Господа Иисуса Христа) - русское народное название праздника Преображения Господа Бога и Спаса нашего Иисуса Христа. Отмечается православной церковью с IV века 6 августа (по новому стилю 19). Этот праздник особо почитаем жителями городского поселения, и отмечается ими как день города. Из трёх Спасов Яблочный Спас является самым главным. На территории поселка действует православная церковь Преображения Господне, что также символически отражено в гербе городского поселения через образ преобразования яблочных цветков в плод - яблоки. Символика яблони многозначна: - символ плодородия; - символ молодости и красоты, бессмертия; - символ братства и согласия. Красный цвет - символ труда, жизнеутверждающей силы и красоты, праздника, мужества. Голубой цвет - символ возвышенных устремлений, искренности, преданности, возрождения. Желтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, великодушия, богатства, урожая. Белый цвет (серебро) - символ чистоты, ясности, открытости, божественной мудрости, примирения. | 
