Флаг Железнодорожного муниципального образования разработан на основе герба Железнодорожного муниципального образования и повторяет его символику. Для обеспечения учреждений Восточно-Сибирской железной дороги продовольствием 1929 году было создано коллективное подсобное хозяйство. Первоначальное название хозяйства было "Молочно-овощной комбинат "Ангара", а его центр располагался в деревне Китой (входит в Железнодорожное МО). В 1930 году подсобное хозяйство выделили в самостоятельную организацию - совхоз, основной задачей которого стало выращивание картофеля, овощей, производство молока, а затем и мяса. Совхоз и посёлок получили название "Железнодорожник". В настоящее время ЗАО "Железнодорожник" остается крупнейшим предприятием муниципального образования и по объему продукции и по поступающим в бюджет поселения налогам. Символика флага Железнодорожного муниципального образования многозначна. Составное полотнище - отражает сочетание освоенных человеком территорий (красный цвет) с участками первозданной природы (зеленый цвет). Пояс из белых и черных квадратов - аллегория Восточно-Сибирской железной дороги, проходящей по территории муниципального образования, что аллегорически указывает на название поселения. Белые квадраты - аллегория кристаллов соли, символизируют территориальную принадлежность поселения Усольскому району, в гербе которого также присутствуют кристаллы соли. Солнце - символ тепла и света, символ процветания и стабильности. Цветки картофеля - символизируют сельскохозяйственное предприятие ЗАО "Железнодорожное", входящее в число лучших по России (62 место по объёмам производства сельхозпродукции). Зелёный цвет символизирует весну и природу, здоровье, молодость и надежду. Красный цвет (червлень) - символ труда, мужества, жизнеутверждающей силы, красоты и праздника. Белый цвет (серебро) - символ чистоты, открытости, божественной мудрости, примирения. Желтый цвет (золото) - символ высшей ценности, величия, богатства, урожая. Чёрный цвет символизирует благоразумие, мудрость, скромность, честность. | 
